阻碍卵子与精子结合或阻碍受精卵着床的原因。如先天性无子宫、无阴道、子宫发育不良（幼稚型子宫）及子宫畸形，或阴道、处女膜闭锁等。后天性如各种生殖炎症，包括阴道炎(滴虫、霉菌、淋病等)和重度宫颈炎，产生大量黄脓样分泌物，影响阴道酸碱度不利于精子活动和生存的结核性输卵管炎可能导致输卵管腔堵塞。
“原因不明”性不孕。约占不孕症总数的１０％。得了不孕症进行全面系统检查，其中包括全身体格检查，生殖器官状态及功能检查。
影响卵巢产生卵子的原因是先天性卵巢缺陷或发育不全等先天性因素，后天性因素如肿瘤、炎症、手术、放射线破坏或切除卵巢组织，不能产生卵子。
内分泌功能的原因。女性患全身性疾病，精神过度紧张或不安引起的神经内分泌功能障碍、营养不良或维生素不足、急性传染病、结核病、各种物理因素(铅、乙醇、烟草等)引起的慢性中毒，可引起不育症。