破坏阴道内微生态环境
阴道微生物菌群主要栖居在阴道侧壁的粘膜、皱褶中，其次在阴道穹窿和宫颈处。健康妇女阴道排出物中的活菌数为100~1亿个/毫升。目前公认的阴道正常菌群中最重要的成员是乳酸杆菌，其数量可达8000万个/毫升，其功能主要是保护阴道不受外来菌的侵袭，是阴道的“健康卫士”，所以医学上常以阴道分泌物中乳酸杆菌的数量来确定阴道的清洁度及判断阴道自洁功能的好坏。有学者调查了40名健康育龄妇女，92.5%都有乳酸杆菌，而更年期妇女则仅有60%。
如果经常使用阴道清洁液冲洗阴道，乳酸杆菌就会更少。
最近国外学者分析了30年来有关妇女阴道冲洗的报道，结果发现，每周冲洗一次或一次以上者，可明显增加盆腔感染的机会，中度增加宫外孕的危险，冲洗越频繁，盆腔感染的危险性就越大。
增加性传播疾病的发生
按习惯或误导，在不洁性交之后，女性大都用冲洗液冲洗阴道，一是防止受孕二是怕传染上性病，但医学调查结果却恰恰相反。印尼的医生曾对599例产前妇女进行分析，结果发现，经常使用冲洗液进行阴道冲洗的妇女患性病的危险性反而增加，但在性生活后用清水冲洗阴道则没有危险性。这项调查也证明，冲洗液破坏了阴道酸碱度（pH），致病菌必然会急剧生长，所以性病的感染率增加。而清水没有改变阴道的酸碱度，故不会破坏阴道正常菌群。
降低生育率
美国学者观察848位已婚妇女发现，用阴道冲洗液冲洗阴道的妇女，预期妊娠每月降低了30%，年轻者较年长者降低更明显。其原因可能是阴道的酸碱度和微生态环境发生改变，病原菌繁殖生长，导致某种疾病的发生，最终导致不育症。
笔者认为，由于阴道正常菌群具有“自洁功能”，一般情况下，无需用灌洗液冲洗阴道。患有各种疾病的患者出于治疗目的，在医生指导下选用治疗冲洗剂是必要的，但绝不能长期使用。
延伸阅读：频繁冲洗阴道引来宫外孕
生殖道患有炎症的妇女在局部用药前先作一下阴道冲洗，然后再塞药，可以提高疗效，还能去除局部不适感，于是有部分女士经常要求作阴道冲洗，她们认为阴道冲洗能增加阴道抗菌能力，辅助治疗各类阴道炎。
频繁冲洗阴道引来宫外孕，其实，这种看法是不正确的。
尤其是自行配制或市售的冲洗液、器具，更使阴道冲洗不安全。
国外有人作了研究后发现，常用市售冲洗器具冲洗者，发生宫外孕的危险性是从来不作阴道冲洗者的3—4倍；使用一次性器具者，该危险性发生率也增加3倍多；无论是市售还是自配的冲洗液，都会增加3—4倍。
究其原因，与以下4个因素有关。一是阴道冲洗会损伤输卵管的正常结构，导致输卵管炎、盆腔炎等；二是消毒不严甚至未消毒的受污染的溶液进入输卵管后，可导致症状不明显的输卵管感染，或者发生输卵管炎、盆腔炎，继之炎症处及其周围组织的疤痕形成；三是原先已存在于阴道或子宫颈的感染病原体，在阴道冲洗时可侵入到输卵管；四是冲洗液的本身，就有可能损害输卵管的纤毛上皮结构，或者有不良的刺激作用，所以，阴道冲洗只能在医生指导下偶尔一用，不能频繁使用。其实，只要每天清洗外阴和换洗内裤，就能达到洁身目的，无需阴道冲洗，以免防病不成反添新疾。