尽管有些男子的性器官疾病不是性传播疾病，但也不宜进行性生活，以免加重病情或影响女方。男性性器官疾病包括：
①性器官先天畸形，如外生殖器异常、重度尿道下裂等，患者尿道口并非开在阴茎头端部，而是开在阴茎体内或会阴部等，会使阴茎勃起时出现障碍，尿道下裂还会影响射精。
②性器官急性炎症，如睾丸炎、附睾炎、精索炎、前列腺炎、精囊炎等，特别是在急性发作期，应禁止性生活，因为性交时性器官高度充血与水肿，性刺激会加重病情并增加不适。
③性器官的特殊感染，如结核、性病、滴虫病等，患病期间过性生活在加重病情的同时，也会将病传染给配偶。④某些性器官肿瘤，如阴茎癌、睾丸肿瘤、前列腺癌等必须停止性生活，否则性交可加速性器官的血液循环，提高癌细胞转移的风险，而且对女性的健康也不利。
⑤性器官的皮肤病，如阴茎部的疣、阴囊部的湿疹等，会因房事不洁而增加继发细菌感染的机会，所以要在病情基本控制后才能行房事。此外，泌尿系统感染，尤其在罹患尿道炎、膀胱炎时，也要停止性生活。