女性适量食用南瓜子通常无害，但过量可能引发胃肠不适、过敏反应、体重增加等问题。南瓜子含有丰富的不饱和脂肪酸、镁元素和锌元素，对调节激素平衡和皮肤健康有益。
南瓜子外壳较硬，过量食用可能刺激胃肠黏膜，出现腹胀或消化不良。胃肠功能较弱者空腹大量进食可能诱发隐痛，建议剥壳后少量分次食用。部分人群对南瓜子中的植物蛋白敏感，食用后可能出现皮肤瘙痒或口腔黏膜水肿，过敏体质者需谨慎尝试。
每100克南瓜子热量超过500千卡，长期过量摄入可能影响体重管理。减肥期间女性应注意控制每日摄入量在20克以内。南瓜子含有的植酸会干扰铁、钙等矿物质吸收，贫血或骨质疏松患者应避免与补剂同食。
建议选择原味烘焙南瓜子避免添加剂摄入，经期女性可适当食用帮助缓解焦虑情绪。储存时需密封防潮，霉变南瓜子会产生黄曲霉素等有害物质。出现严重过敏反应或持续性腹痛应及时就医，日常可将南瓜子搭配燕麦粥或酸奶平衡营养。