研究表明，男性疾病中常见的前列腺炎和沙眼衣原体可能有很大关系，临床某些前列腺炎尤其是慢性炎症、反复发作的或加重的无菌性前列腺炎，沙眼衣原体可能就是这类前列腺炎的主要诱因之一。这类前列腺炎病人除了会出现会阴不适、疼痛、尿频、尿急等排尿异常外，更有可能久治不愈，导致性生活质量下降，甚至性功能障碍。
前列腺液是精液中非常重要的组成部分，一旦前列腺发炎，则炎症渗出物的增加会影响精液的质量，如精液液化不良，导致精子活力下降，从而影响受孕。
研究明确表明，女性感染沙眼衣原体后，沙眼衣原体可由宫颈上行到子宫和输卵管，引起无症状的上生殖道感染，导致异位妊娠、原发性不育。
长期沙眼衣原体炎症会导致输卵管内膜细胞发生变性改变，久而久之，输卵管也会与周围脏器发生粘连，使输卵管蠕动发生障碍。这种病变达到一定程度，可影响受精卵的运送，严重者导致输卵管闭塞。
因此，一旦出现眼部不适，要积极就诊。一旦患有沙眼不仅可能影响视力，甚至会造成不孕不育。