传统上，PE被认为是心理和人际关系的基础，在很大程度上是由于焦虑或调节的基础上对快速射精冲动早期的性经验。但随着神经生物学和遗传学的发展，对早泄的病因有了一定的新的认识。早泄的神经生物学方面，5-羟色氨酸调节异常作为先天性早泄的假设病因，被认为仅能用来向早泄人群中很小的一部分(2—5%)做出解释；早泄的遗传学方面，目前的证据表明，个体的基因多态性可能对射精延迟有微小的影响，伴有大量的遗传变异的男性可能倾向于患有早泄，但仍缺乏相关数据或存有争议。
对特殊患者人群的风险因素研究中也有所发现。
1.在对甲状腺激素的研究中发现，甲状腺功能亢进症(一种获得性疾病)对于原发性早泄没有作用，但在极其少的病人中被发现与继发性早泄有联系。在对其他激素的研究中发现，低催乳素血症和较高的睾酮水平不被认为是继发性早泄的病因。激素水平异常和早泄之间的关系还不明确。
2.慢性前列腺炎(CP)
慢性前列腺炎引发早泄的机制暂不明确，在现存的数据中依然有方法上的局限性。尽管临床上推荐对于慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合症(CP/CPPS)患者并有射精疼痛症状要进行体格检查和微生物学检查，但对于早泄患者有这方面困扰的筛选路径依然不足。
3.勃起功能障碍ED
ED并不是原发性早泄的并发症或致病因素，但有研究数据表明继发性早泄与勃起功能障碍有关联。在这种情况下，男性可能会有焦虑导致的快速射精，或者是在性器官肿胀充血消退之前就刻意完成射精。同时患有早泄和勃起功能障碍的病人可能存在症状叠加，此外这些男性可能会有性满意度减低，和对早泄治疗反应减退。
心理因素的相关研究认为，心理因素导致早泄的说法，看似合理，反之亦然。对于很多男性，早泄与其它因素相伴而行。例如，焦虑症很可能引发早泄，然而早泄的加重更会加重原发性的焦虑。
性伴侣的重要性及早泄对伴侣性功能的影响也不容忽视，早泄对于男性及其伴侣均会造成负面影响，存在早泄相关的人际交往困难以及整体生活质量的下降。