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尖锐湿疣发病时，男性常发于龟头，包皮内板，女性外阴，宫颈，阴道，尿道口等。
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在生殖器温度较低而且干燥部位的损害经常表现为小而扁平状，而在温热、湿润部位者常呈丝状或乳突瘤状，初发时为少数微小淡红色丘疹。
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随病情加重丘疹渐渐增大及增多，表面凹凸不平，湿润而柔软，呈大小不等的乳头样，摹样或融合成大团块呈菜花样突起，红色或污灰色。
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严重事其根部常有蒂，易发生糜烂、渗液，触之易出血，皮损裂隙中常有混浊的浆液或脓性分泌物，散发恶臭，自觉有痒感，常因搔抓而引起细菌继发感染。
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发生在直肠内大的湿疣可引起里急后重感。尖锐湿疣的潜伏期为1-6月，平均为3个月。最长的潜伏期可达一年。男性患上尖锐湿疣的方法几乎都是经过性接触感染而上的。
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由于局部潮湿与不断受到慢性激刺，往往增长迅速。极少数病人由于治疗不及时，使湿疣长得很大，成为巨大湿疣，可向深部穿透，产生很多瘘管通向尿道或经5-40年恶变为癌肿。
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在包皮过长或白带多者更易促使发病，初为粟粒大淡红色赘生物，后渐增大，数目增多，柔软，可呈乳头状，蕈状，菜花状突起，大的疣易继发感染，糜烂，化脓，出血，恶臭味。