补肾保健品在合理使用下通常对身体无害，但滥用可能引发健康风险。过量服用可能导致肝肾负担加重、激素水平紊乱、胃肠刺激、药物相互作用以及掩盖潜在疾病等问题。
部分补肾保健品含高浓度中药提取物或矿物质，长期过量摄入可能增加肝肾代谢压力。尤其是含何首乌、马兜铃酸等成分的产品，未经专业指导使用可能造成肝肾功能损伤。肝肾作为人体主要解毒器官，长期超负荷工作可能导致器质性病变。
某些宣称快速见效的保健品可能违规添加激素类物质。这类成分会干扰人体正常内分泌系统，导致睾酮等性激素分泌失衡。短期可能出现痤疮、情绪波动，长期可能诱发前列腺增生、精子质量下降等严重后果。
补肾保健品中常见鹿茸、海马等动物性药材，其蛋白质大分子结构可能刺激胃肠黏膜。敏感人群服用后易出现腹胀、腹泻或过敏反应。空腹服用时刺激性更强，可能诱发慢性胃炎患者症状加重。
正在服用降压药、抗凝药或精神类药物者需特别注意。例如含淫羊藿的保健品可能增强抗凝效果导致出血风险，与人参同服的降压药可能引发血压骤降。中药西药混用产生的化学反应可能抵消药效或产生毒性。
盲目依赖保健品可能延误真正疾病的诊治。腰膝酸软、性功能减退等症状可能是糖尿病、心血管疾病或心理问题的表现。仅通过保健品缓解症状而不解决病因，可能导致病情持续恶化。
选择补肾保健品前建议进行专业中医体质辨识，阴虚阳虚用药差异显著。日常可通过食补调理，如黑色食物含天然抗氧化物质，深海鱼富含锌元素，坚果类提供精氨酸。保持规律运动、控制烟酒、保证睡眠等基础生活方式改善，比单纯依赖保健品更安全有效。出现持续不适症状应及时就医，避免自我诊断用药。