沙丁鱼的营养价值较高，富含优质蛋白、不饱和脂肪酸、维生素D、钙和硒等营养素。
沙丁鱼是小型深海鱼类，其蛋白质含量超过20%，属于高生物价蛋白，人体吸收利用率高。鱼油中富含欧米伽3脂肪酸，尤其是EPA和DHA含量突出，这两种脂肪酸对心血管健康、大脑发育和抗炎作用有显著益处。每100克沙丁鱼可提供约200毫克钙质，鱼骨中的钙经过加工后更易被人体吸收。维生素D含量在鱼类中名列前茅，有助于促进钙质吸收和免疫调节。沙丁鱼还含有丰富的微量元素硒，具有抗氧化和保护细胞膜完整性的作用。
新鲜沙丁鱼容易腐败变质，通常采用罐头加工方式保存，选择水浸罐头可减少油脂摄入。部分人群可能对鱼类过敏，食用后出现皮肤瘙痒或胃肠不适需立即停止食用。沙丁鱼嘌呤含量中等，痛风急性发作期应限制食用。孕妇选择低汞品种的沙丁鱼可安全补充DHA，但需避免生食防止寄生虫感染。
建议每周食用2-3次沙丁鱼，可采用清蒸、烤制等低温烹饪方式保留营养。搭配富含维生素C的蔬菜水果可促进铁吸收，避免与浓茶同食影响矿物质吸收。选购时注意罐头包装完整性，开罐后未食用完需冷藏保存。特殊人群如肾功能不全者需控制摄入量，儿童食用时注意去除细小鱼刺。